Normalized intensity values for 334 genes with known location (CHR=chromosome), for normal (N) and DS (D) subjects, in experiments 1, 2, 3 and 4, respectively. GENE CHR N1 N2 N3 N4 D1 D2 D3 D4 ABLIM 10 237 304 505 553 243 459 281 429 ACAT2 6 133 423 193 400 566 1147 252 1060 ACE 17 546 1402 562 586 687 2550 449 856 ACTB 7 8862 3918 2433 16653 10551 3962 3195 11675 ACTBb 7 3637 2019 2336 6152 1360 2486 1922 5129 ACTR2 2 522 452 554 1302 433 734 837 1496 ADF 20 402 596 208 331 711 1069 342 703 ADRBK1 11 3380 187 471 2473 3552 546 539 2234 AK2 1 225 629 310 426 607 1069 412 948 AKR1C1 10 1702 46 220 1791 226 605 915 1531 APEX 14 1349 1398 1181 1620 1277 2325 918 2481 AQP1 7 3308 2109 1132 2711 2830 2229 1298 2186 ARF1 1 824 1495 954 580 1070 3472 801 1307 ARF4 3 413 662 592 535 731 1926 803 891 ARF6 7 412 327 367 637 459 734 553 918 ARHA 3 1287 2573 1246 2068 1194 2917 1930 3259 ARHGDIB 12 4079 5859 3625 8663 4218 6150 2504 7542 ARPC2 13 3924 2753 1165 2732 4561 3041 1724 2558 ASNS 7 1674 202 50 676 338 216 822 880 ATP5B 12 1365 1248 502 734 1579 1417 654 889 ATP5C1 10 1715 823 222 320 1067 1417 853 823 ATP5F1 18 360 675 160 662 689 825 231 786 ATP6E 22 819 439 48 221 805 1046 407 456 ATP6N1A 17 1606 1835 211 698 1092 3045 352 1515 B2M 15 7039 4177 29 1200 5259 6851 264 3298 BCKDK 16 1140 233 44 714 211 523 342 767 BCL2L2 14 1474 177 151 786 325 821 746 1305 BST2 19 786 569 560 1422 623 1807 775 1307 BTG1 12 4467 179 256 208 3726 440 404 311 CADPS 3 1523 148 394 1729 461 715 1731 2116 CALM2 2 987 928 317 932 1001 1623 619 1597 CAMK2G 10 838 605 469 1327 679 1151 587 1496 CASP3 4 857 368 238 786 529 963 714 1150 CCT4 2 840 355 163 334 246 793 384 366 CD24 6 22524 47 1244 10560 27943 748 1256 7503 CD48 1 2709 3994 1559 1385 2684 5155 1187 2816 CD74 5 1808 1635 633 1268 2622 15198 2431 5552 CDH13 16 222 223 215 467 296 440 360 611 CDO1 5 1394 685 122 1362 1182 1215 309 1349 CFL1 11 1930 2627 342 281 3754 5329 485 839 CHI3L1 1 396 8 19 341 148 569 523 329 CHS1 1 4589 500 208 976 4469 766 156 1139 CIAO1 2 1777 170 345 562 288 720 1430 909 CLK1 2 1706 523 71 1055 353 1096 667 1316 CLOCK 4 1326 717 1136 2940 1009 537 1029 2740 CLPS 6 9676 77 863 1981 439 1128 5031 3749 COL5A1 9 26462 156 3335 35176 34564 807 2347 19147 COL6A3 2 1829 295 158 3181 418 674 691 2582 COPS3 17 323 473 559 484 552 903 343 696 CPB1 3 350 182 241 925 1185 848 258 1489 CPSF1 8 1601 635 306 1291 523 573 704 1336 CRYAB 11 4228 63 683 2062 177 1371 3520 2720 CSF2RA X 19772 312 2812 2066 32959 1403 2233 2808 CSTB 21 1383 824 453 1127 2336 2100 570 1612 CUGBP1 11 432 450 397 616 314 702 566 705 DARS 2 960 1852 329 511 1418 1463 432 762 DDOST 1 2398 2277 1001 3129 2820 2898 898 3462 DEGS 1 9582 776 2327 467 13195 2857 1949 986 DLST 14 759 566 256 389 837 559 399 598 DNAJC8 1 189 442 152 430 649 885 325 672 E2F4 16 828 451 638 1471 611 1605 1895 1524 EEF1B2 2 2642 6638 2422 2747 1856 4270 1647 2759 EEF1G 7 2879 2050 641 2190 2780 1523 554 1102 EHD1 11 2442 440 459 3134 698 940 2066 3038 EIF3S6 8 1442 728 233 904 532 885 533 918 EIF4A1 17 879 841 428 805 1003 1642 511 909 EIF4G2 11 207 390 221 493 247 555 373 405 EMAPL 14 899 596 265 860 1001 1454 701 1198 EMD X 284 250 346 677 332 101 288 532 ENO1 1 6850 6276 4124 4991 7121 10286 5732 6680 ENO2 12 1139 593 56 409 772 1041 245 438 EPB72 9 4006 271 487 3015 4552 871 514 2952 ERPROT213-21 19 675 244 314 1037 254 780 1332 964 F2R 5 5596 146 238 830 5638 981 1111 1299 FGFR2 10 2425 58 243 2120 4048 472 339 1653 FKBP5 6 2571 2340 516 788 1831 5526 793 2624 FLOT1 6 985 2296 1237 626 1003 1458 456 182 FOLR1 11 906 30 263 1111 64 807 972 940 FTH1 11 2589 1919 449 1442 3369 8058 786 2446 FTH1b 11 3207 4591 1264 1526 3290 15537 1979 4560 FTL 19 2967 2794 93 194 2244 8681 508 1113 FUT2 19 6177 44 1258 17894 800 445 7212 16786 GABRG2 5 565 211 2321 765 2160 3077 3589 3903 GAPD 12 5825 5028 510 2446 10409 20875 1175 4119 GDI2 10 4528 5080 738 4579 5225 4260 994 3351 GEF-2 16 1983 606 165 539 909 1234 572 852 GLRA2 X 2156 2976 606 2353 1965 6943 1512 3287 GLUL 1 887 143 170 699 191 1623 498 780 GNAS1 20 675 1235 415 537 541 2311 469 948 GNB2L1 5 4315 6159 705 2366 3695 4155 841 1767 GP1BB 22 5374 4868 4539 6826 5575 4540 3012 5238 GPX1 3 1268 633 244 782 659 981 695 1141 GPX3 5 109 80 170 406 169 1128 373 593 GSTM2 1 1101 308 226 1593 404 188 984 1165 GSTP1 11 4645 666 515 3284 1015 1454 1999 2724 GSTTLp28 10 2172 1050 999 6328 1223 2325 2510 5869 GTF2B 1 2183 417 438 1730 3420 468 450 1866 GTF2F1 19 383 393 489 924 648 803 294 935 H3F3A 1 2621 2914 1196 3836 2534 2999 1138 3289 HBP1 7 2693 469 304 2370 380 619 1557 2834 HLAA 6 22206 19674 14211 29357 20954 48763 23458 52634 HLAB 6 2142 572 218 345 2139 1279 181 747 HLAC 6 4186 1564 176 510 5842 3403 554 1042 HLAC_b 6 9542 3922 1026 1254 15538 8915 1679 2297 HLADRB3 6 110 162 90 92 1234 12910 778 2056 HMG1 13 1772 554 182 289 858 642 821 532 HMG17 1 455 2059 550 315 1397 4169 452 1264 HMG4 X 755 123 125 559 374 867 620 878 HNRPA1 12 5869 2264 237 2003 3350 2426 339 2632 HNRPA2B1 7 4958 1735 809 1971 3240 1857 2115 2667 HPRT1 X 458 679 559 1615 567 1059 472 2170 HREV107 11 697 186 274 1417 199 2385 836 1259 HSPCA 1 3149 3011 1152 2293 2223 3650 1602 4111 HSPCB 6 704 1063 291 453 602 1513 236 852 HTATSF1 X 1042 942 466 1205 689 1371 260 648 HUMMLC2B 16 2405 3328 301 320 2734 7250 653 1102 ICAM1 19 2191 116 255 1090 2285 697 439 1012 ID2 2 2239 1331 1011 2142 1079 1903 873 2422 IGF2R 6 832 180 428 452 1212 848 415 436 IGHMBP2 11 1888 167 419 1283 352 592 1819 1993 IGKC 2 14106 8218 952 2754 19331 20678 2490 6844 ITM1 11 1770 1543 756 1399 776 1628 926 1480 JUND 19 490 712 276 535 776 1770 195 837 KCNAB2 1 240 451 274 496 624 940 386 734 KIAA0016 1 1399 1314 499 1079 1286 2091 798 1296 KIAA0054 17 3989 238 485 2142 3973 867 444 1925 KIAA0102 11 694 974 720 662 1448 1944 1044 1384 KIAA0110 6 5128 419 592 3684 5244 660 890 2748 KIAA0111 17 1762 646 336 1466 1729 1229 595 1621 KIAA0218 3 766 249 279 696 425 679 838 810 KIAA0226 3 2741 154 229 1855 2806 477 459 1362 KIAA0391 14 9783 2249 237 3331 4585 2444 353 3191 KIAA0441 6 5876 134 851 1272 5457 991 1214 1318 KPNA2 17 557 423 208 616 505 830 412 808 KPNB1 17 361 558 257 296 565 789 348 646 LAG3 12 1242 947 436 814 1435 2444 2052 1601 LAIR1 19 2897 339 387 2392 3286 844 378 1862 LAPTM5 1 1962 1940 122 872 2341 2825 405 948 LAPTM5b 1 1941 2337 796 1391 2219 4595 872 1215 LDHB 12 2220 1656 69 550 1370 1692 763 839 LUM 12 1326 63 133 438 260 440 1401 694 MAP1A 15 588 833 688 693 725 1261 543 1106 MAP2 2 1428 948 291 977 1614 2068 284 1117 MAP3K3 17 4997 2388 2012 7938 3758 3582 2440 10825 MATK 19 1042 480 150 1279 354 610 572 1183 MBNL 3 2230 2528 276 1245 2200 2132 247 1240 MED6 14 4250 472 510 2383 4336 917 601 2330 MLANA 9 3761 276 415 1166 3831 651 496 1064 MNPEP 12 878 317 277 666 475 642 1704 1104 MYBPC3 11 4161 81 811 1784 5263 541 577 2091 MYL1 2 2043 73 373 2940 1546 1004 1161 3250 MYL1b 2 761 484 435 2224 692 1454 731 2212 MYL2 12 530 73 296 752 185 486 465 679 MYL6 12 520 352 684 1288 704 674 528 1091 NACA 12 3188 3288 686 2817 3220 3178 836 2519 NAP1L1 12 2798 2479 515 1266 2132 3426 389 1121 NCF1 7 992 438 423 3218 511 926 720 2884 NCOR1 17 767 251 166 585 273 587 688 872 NDUFA6 22 3638 99 1332 6708 3868 564 912 6443 NDUFV2 18 2023 944 599 4411 1036 2201 1986 4349 NEUROD1 2 1642 139 1268 2341 2016 367 568 2519 NFIL3 9 2066 1672 1110 2956 2185 2316 1068 2505 NHP2L1 22 662 698 110 484 673 624 196 677 NINJ1 9 277 446 285 1064 684 899 370 1483 NIPSNAP1 22 679 862 492 957 668 1623 688 1003 NK4 16 2927 2092 494 685 3292 2440 434 1866 OAZ1 19 2287 879 383 568 824 1853 1852 913 P4HB 17 991 1263 604 74 2421 3123 924 488 PBP 12 2429 525 244 1331 2599 890 245 1159 PCBP1 2 3142 2881 827 1827 2839 3417 877 1505 PCTK1 X 157 278 94 189 224 1472 307 729 PDE4D 5 4229 3834 1316 2953 3242 7911 1063 6007 PDK2 17 686 566 440 771 523 601 301 828 PGAM1 10 1981 2406 58 727 1994 4916 467 1719 PGK1 X 1938 2538 263 957 2063 3118 785 1159 PGM1 1 477 194 78 470 277 775 310 471 PHB 17 1301 347 353 1127 429 619 1301 1200 PHKA1 X 3397 265 67 2084 1305 991 476 2411 PLP2 X 1974 703 122 527 913 1009 1068 666 PMM2 16 2499 3443 151 830 2321 2852 430 1152 PPAP2A 5 559 1419 457 378 1143 3971 416 758 PPIA 7 1277 1115 814 1738 1452 2619 1105 2508 PPID 4 11202 585 3119 12953 12733 1541 1590 7604 PPP2CA 5 1626 427 495 1883 404 1023 1642 1969 PRCP 11 693 451 114 170 369 486 531 247 PRKDC 8 347 533 328 370 290 376 299 486 PSMB4 1 3170 1194 795 1842 1928 1807 1893 1833 PSMD1 2 149 512 81 218 456 601 225 434 PSMD11 17 798 665 430 1306 579 761 794 1259 PTCH 9 2823 1445 202 2115 3163 1435 218 1686 PTK2B 8 1943 1439 409 1233 2128 1348 410 946 PTMA 2 3484 1904 906 1802 1796 2609 1169 1494 PTMAb 2 6666 6581 1317 1571 5675 9897 604 2284 PTPNS1 20 1347 238 695 1773 1585 1316 645 1255 PTPRA 20 994 252 33 306 321 569 378 344 PTPRG 3 1805 604 313 1378 1772 1243 638 1678 PUM2 2 2520 263 307 779 3191 468 297 1049 RAB11A 15 5490 244 494 3793 374 793 2782 3640 RAB6A 2 1136 421 399 1268 1275 1027 506 1378 RAB7 3 7738 809 970 1461 12534 1009 1255 1305 RalGPS1 9 560 608 300 527 945 1128 235 821 RAN 6 980 984 360 449 1343 903 427 902 RAP1A 1 512 691 42 913 532 1018 209 1417 RARA 17 2670 250 338 1359 358 1036 1279 1728 RBM3 X 33475 1574 8489 5955 36815 2201 11135 10392 RBM4 11 2719 577 229 1963 478 1055 1197 1717 RBM5 3 184 1070 176 753 125 1000 265 782 RELA 11 298 486 300 391 635 1151 725 751 RFP 6 470 332 111 721 31 559 472 661 RGS19 20 243 500 287 305 699 977 408 637 RGS3 9 859 287 640 918 508 532 487 1106 RNAHP 17 978 390 536 499 254 807 1696 850 RPL10 X 21944 23962 20689 20594 24535 17642 10604 14207 RPL10A 6 5441 6053 1394 4200 5300 3939 1303 3539 RPL12 2 2267 2709 791 2309 2427 2288 879 1822 RPL13A 19 8359 6286 6894 13275 9397 7943 3322 9229 RPL18 19 527 2304 251 325 626 3164 345 462 RPL19 17 10044 7348 4933 6575 8853 4957 3700 7087 RPL21 13 5451 2580 1062 3634 5580 3036 1094 4244 RPL21b 13 11838 7144 779 3544 10102 10497 2224 4268 RPL22 3 2000 1728 886 713 1386 1871 2063 944 RPL27 17 3388 3979 839 3321 3881 3407 1075 3427 RPL27A 11 17036 7875 4222 19196 17392 8369 4812 12669 RPL28 19 3158 5749 4409 5716 4003 5760 2334 4238 RPL3 22 6401 4054 1471 4389 4952 3462 1023 3425 RPL32 3 7106 6223 1331 5565 8713 4669 1227 4599 RPL36A 14 2995 2871 3076 5148 2360 2990 2282 5506 RPL37 5 2709 1943 236 2001 3334 2596 212 1756 RPL37A 2 2660 1725 740 1982 3336 2454 492 2072 RPL38 17 1770 1746 709 2200 2212 2105 682 2604 RPL39 6 3719 2383 1137 2026 4083 2531 1017 2976 RPL5 1 7551 8593 1904 7529 5497 5957 1770 5650 RPL6 12 1302 2266 722 1497 1196 2045 717 1831 RPL7 8 14749 13743 1525 2531 13385 13501 3643 4470 RPS10 6 1985 2354 409 1134 2118 2256 590 1540 RPS11 19 6987 8727 2475 4642 8620 7915 2818 6270 RPS13 11 4656 5197 1809 6018 4982 4650 1457 4380 RPS15A 16 9265 4740 714 5057 8521 5384 1593 5381 RPS19 19 7465 5582 745 1976 5851 5755 3020 2799 RPS2 16 5390 3955 1124 2796 4760 4357 1379 3287 RPS23 5 3093 3316 593 1936 2660 2518 844 2341 RPS5 19 835 1745 282 890 919 1999 344 922 RPS6 9 4251 6068 4624 6680 3111 5136 3664 6117 RPS9 19 2495 1403 403 918 3285 2898 340 1235 RSU1 10 30 269 173 149 451 688 241 512 RXRG 1 210 85 168 325 382 734 468 804 S100A9 1 1047 48 221 361 137 404 628 745 SAP18 13 1990 830 308 2954 844 1711 915 2718 SARCOSIN 2 354 68 33 303 218 949 454 762 SC4MOL 4 5023 87 1300 5729 5186 858 668 4844 SC65 17 2853 418 797 2053 3098 546 374 1699 SCD 10 2358 2190 423 860 1549 4049 546 2313 SCYA21 9 5761 93 389 1398 385 867 2067 1910 SCYE1 4 474 2021 657 650 1046 2642 749 1332 SDHC 1 1574 1039 2104 3483 1844 2169 1382 4989 SEMA3E 7 3588 32 2299 1100 5042 468 1217 1334 SEMA4D 9 3520 1982 1342 4056 3947 2325 972 3857 SEPP1 5 566 335 196 452 517 839 435 764 SEPW1 19 382 312 115 349 574 1215 453 410 SERPING1 11 2782 3852 802 675 3503 4554 574 1128 SET 9 1701 1452 774 1699 1308 1871 960 1647 SF3B2 11 464 857 268 378 468 1023 339 622 SFRS11 1 1250 1417 337 1891 370 1711 937 1800 SFRS2 17 754 1228 621 663 640 848 645 1060 SFRS9 12 4764 3589 250 465 3596 10057 373 1934 SLA 8 659 521 136 440 595 628 373 552 SLAb 8 288 566 57 255 401 945 371 543 SLC1A5 19 2745 201 485 2697 3624 692 535 1178 SLC20A2 8 879 149 108 314 227 477 992 869 SLC6A6 3 6985 146 941 1066 9558 500 392 1397 SLC7A1 13 1955 321 773 2549 2802 624 685 1404 SMARCA1 X 3630 3719 831 2542 3145 3293 730 2203 SMARCA2 9 1320 284 159 1193 1360 578 85 1154 SMN1 5 2793 270 407 1798 2649 775 381 1450 SMS X 862 617 342 947 345 642 804 1093 SMT3H1 21 1741 645 286 1647 1459 807 993 1710 SMT3H2 6 13041 8961 4523 17518 8779 17312 7639 22861 SNRPB 20 1497 275 132 1029 711 509 473 1167 SNRPF 12 1591 372 605 1366 771 1087 2692 1564 SOD1 21 76 321 61 283 426 1050 258 944 SON 21 1049 1771 1389 944 1189 1816 1374 1618 SOS2 14 2052 1219 310 2692 2822 1848 296 1636 SPN 16 9318 32 2181 11921 7551 504 1113 9027 SPOCK 5 738 296 666 1335 876 1114 521 1724 SPTB 14 2601 1744 513 808 3554 1715 480 1283 SRBP1 9 1358 596 584 3356 1281 1119 593 2713 SSR2 1 3264 631 366 2070 1061 1633 1614 2352 SUCLG1 2 342 2238 1048 599 881 2664 647 894 SUI1 17 6694 13187 3551 4215 7848 21201 4112 4446 SYT1 12 1031 112 374 298 2080 1408 364 434 TALDO1 11 844 791 271 672 475 1518 818 865 TBP 6 1631 173 585 2069 331 798 2492 2118 TCEA1 3 1955 476 291 645 842 958 1413 1305 TCEB1L 5 1791 1152 413 731 1669 1853 2103 1156 TCF8 10 4932 1912 3432 7557 5407 1165 2812 8156 TEGT 12 870 1105 173 406 1215 2100 261 830 TERF2 16 2511 42 1201 525 3067 592 529 526 TGIF 18 1961 188 180 1551 275 555 851 1614 TIF1B 5 2667 571 470 2466 2657 1078 403 1798 TIM44 19 1739 158 384 497 194 500 1815 731 TIMP1 X 972 356 189 706 662 582 1392 994 TIMP3 22 442 477 641 1338 756 890 460 1947 TMP21 14 297 430 382 299 873 1091 418 666 TMSB10 2 6706 3247 953 3350 8200 6943 3276 4684 TMSB10b 2 5544 4394 1900 7952 6176 9466 4425 10056 TMSNB X 2185 147 503 2339 298 541 1946 2304 TNFRSF10B 8 2678 140 125 1020 3324 500 145 898 TNFSF14 16 4282 27 509 309 5174 1023 502 712 TNNI1 1 490 1076 385 358 976 2316 383 764 TNNT1 19 6082 2461 2555 6962 8036 3031 2312 7707 TPD52L1 6 293 1289 586 523 1132 3426 523 1498 TPMT 6 2439 522 310 2280 2461 890 736 2041 TPT1 13 9832 6674 2740 3485 5741 6755 1767 4549 TRPC1 3 2191 1073 212 1342 4581 770 178 4143 U5100K 12 450 221 100 275 419 715 270 532 U5116KD 17 2868 306 630 1272 528 573 2183 1719 UBA52 19 1392 2262 894 2795 2082 2421 748 2227 UBE2B 5 4082 143 284 3421 213 459 1781 3405 UBE2G2 21 1624 1298 612 2127 1507 1880 731 1864 UBE2I 16 1961 585 618 1258 2321 1756 612 1215 UBE2L3 22 514 427 210 587 331 1220 773 777 UBE2V1 20 526 622 308 424 705 922 427 692 UCHL1 4 229 204 150 205 320 1325 821 679 VIL2 6 3291 947 579 3050 923 1202 1926 2685 XRCC1 19 439 231 303 627 876 876 270 453 YWHAB 20 241 652 440 638 584 770 531 959 YWHAE 17 845 343 445 1441 354 876 1176 1364 YWHAEb 17 1604 270 269 1782 310 816 555 1721 YWHAQ 22 1002 797 176 245 952 1399 589 887 YWHAZ 2 1700 886 89 790 1243 1325 363 1176 ZNF162 11 426 445 355 697 489 587 354 681 ZNF238 1 383 167 251 348 832 766 333 767 ZNF91 19 609 129 117 360 716 766 305 756 ZYG 9 1781 2734 1990 2554 1343 2077 1466 2746